Schönbrunn Sarayı'nın tarihi, bir manastır mülkü olan Katterburg olarak bilindiği 14. yüzyıla kadar uzanmaktadır. 1569'da İmparator Maximilian II, mülkü satın aldı ve onu bir imparatorluk av sahasına dönüştürdü. Mülk, 17. yüzyılda Viyana'nın Osmanlı kuşatmaları sırasında önemli hasar gördü. İmparator Leopold I, 1696'da yeni bir saray tasarlaması için mimar Johann Bernhard Fischer von Erlach'ı görevlendirdi, ancak inşaat gecikti. İmparatoriçe Maria Theresa, 18. yüzyılda sarayın şu anki haline dönüşümünü denetledi. Kapsamlı yenilemeler yaptırdı ve bahçeleri genişletti.
Schönbrunn Sarayı, Habsburg imparatorlarının yazlık konutu ve imparatorluk yaşamının merkezi haline geldi. 1848'den 1916'ya kadar hüküm süren İmparator Franz Joseph, Schönbrunn'da doğdu ve öldü. 1918'de Habsburg monarşisinin yıkılmasından sonra saray, Avusturya Cumhuriyeti'nin mülkü oldu ve halka açıldı. Bugün Schönbrunn Sarayı, bir UNESCO Dünya Mirası alanıdır ve Viyana'nın en popüler turistik mekanlarından biridir.